Watanabe, Chiduru: шукати на сайті Z-Library

Пожертвування 15 вересня 2024 – 1 жовтня 2024 Про збір коштів

Найбільша колекція наукових статей у сіті. 70,000,000+ безкоштовних статей.

Пожертвування 15 вересня 2024 – 1 жовтня 2024

Z-Library - одна з найбільших онлайн-бібліотек у світі, в якій зберігається більше 17,000,000 книг та 84,837,000 статей. Ми намагаємось зробити літературу доступною кожному. Сьогодні (15 вересня 2024) ми відкриваємо додатковий збір пожертвувань на підтримку та розвиток проекту.

Також БЕЗЛІМТНІ завантаження (протягом 31 дня після завершення пожертвування) доступні для ВСІХ користувачів, які підтримають проект в період збору коштів до 1 жовтня 2024.

Про збір коштів Детальніше

Підтримати

Книги
Статті (32)
Найпопулярніші
Перелік
- Перелік
- Таблиця

1

Hydration effects on enzyme–substrate complex of nylon oligomer hydrolase: inter-fragment interaction energy study by the fragment molecular orbital method

Ando, Hiroyuki, Shigeta, Yasuteru, Baba, Takeshi, Watanabe, Chiduru, Okiyama, Yoshio, Mochizuki, Yuji, Nakano, Masayoshi

Журнал:

Molecular Physics

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 669 KB

english, 2015

2

Structural basis of protein arginine rhamnosylation by glycosyltransferase EarP

Sengoku, Toru, Suzuki, Takehiro, Dohmae, Naoshi, Watanabe, Chiduru, Honma, Teruki, Hikida, Yasushi, Yamaguchi, Yoshiki, Takahashi, Hideyuki, Yokoyama, Shigeyuki, Yanagisawa, Tatsuo

Журнал:

Nature Chemical Biology

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.70 MB

english, 2018

3

Fragment Molecular Orbital Calculations with Implicit Solvent Based on the Poisson–Boltzmann Equation: Implementation and DNA Study

Okiyama, Yoshio, Nakano, Tatsuya, Watanabe, Chiduru, Fukuzawa, Kaori, Tanaka, Shigenori

Журнал:

Journal of Physical Chemistry B

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 12.09 MB

english, 2018

4

Accuracy of Dimer-ES Approximation on Fragment Molecular Orbital (FMO) Method ; 側鎖分割したペプチドに対するdimer-es近似のHF及びMP2電子相関エネルギーに与える影響に関する検討;

Nakano, Tatsuya, Fukuzawa, Kaori, Okiyama, Yoshio, Watanabe, Chiduru, Komeiji, Yuto, Mochizuki, Yuji

Журнал:

Chem-Bio Informatics Journal

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 494 KB

english, 2018

5

An interpretation of positional displacement of the helix12 in nuclear receptors: Preexistent swing-up motion triggered by ligand binding

Chiduru Watanabe, Hirofumi Watanabe, Shigenori Tanaka

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.70 MB

english, 2010

6

Effect of electron–electron interaction on 2D multimode Peierls state in the presence of anisotropy

Chiduru Watanabe, Yoshiyuki Ono

Журнал:

Physica E: Low-dimensional Systems and Nanostructures

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 358 KB

english, 2008

7

Phonon softening in Peierls transition in an anisotropic triangular lattice

Chiduru Watanabe, Yoshiyuki Ono

Журнал:

Physica E: Low-dimensional Systems and Nanostructures

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 218 KB

english, 2010

8

Development of the four-body corrected fragment molecular orbital (FMO4) method

Tatsuya Nakano, Yuji Mochizuki, Katsumi Yamashita, Chiduru Watanabe, Kaori Fukuzawa, Katsunori Segawa, Yoshio Okiyama, Takayuki Tsukamoto, Shigenori Tanaka

Журнал:

Chemical Physics Letters

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 474 KB

english, 2012

9

Three- and four-body corrected fragment molecular orbital calculations with a novel subdividing fragmentation method applicable to structure-based drug design

Watanabe, Chiduru, Fukuzawa, Kaori, Okiyama, Yoshio, Tsukamoto, Takayuki, Kato, Akifumi, Tanaka, Shigenori, Mochizuki, Yuji, Nakano, Tatsuya

Журнал:

Journal of Molecular Graphics and Modelling

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.64 MB

english, 2013

10

Accuracy of the fragment molecular orbital (FMO) calculations for DNA: Total energy, molecular orbital, and inter-fragment interaction energy

Fukuzawa, Kaori, Watanabe, Chiduru, Kurisaki, Ikuo, Taguchi, Naoki, Mochizuki, Yuji, Nakano, Tatsuya, Tanaka, Shigenori, Komeiji, Yuto

Журнал:

Computational and Theoretical Chemistry

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.78 MB

english, 2014

11

Modeling of peptide–silica interaction based on four-body corrected fragment molecular orbital (FMO4) calculations

Okiyama, Yoshio, Tsukamoto, Takayuki, Watanabe, Chiduru, Fukuzawa, Kaori, Tanaka, Shigenori, Mochizuki, Yuji

Журнал:

Chemical Physics Letters

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.07 MB

english, 2013

12

Statistical correction to effective interactions in the fragment molecular orbital method

Tanaka, Shigenori, Watanabe, Chiduru, Okiyama, Yoshio

Журнал:

Chemical Physics Letters

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 653 KB

english, 2013

13

Interaction energy analysis on specific binding of influenza virus hemagglutinin to avian and human sialosaccharide receptors: Importance of mutation-induced structural change

Anzaki, Satoshi, Watanabe, Chiduru, Fukuzawa, Kaori, Mochizuki, Yuji, Tanaka, Shigenori

Журнал:

Journal of Molecular Graphics and Modelling

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.88 MB

english, 2014

14

Charge Clamps of Lysines and Hydrogen Bonds Play Key Roles in the Mechanism to Fix Helix 12 in the Agonist and Antagonist Positions of Estrogen Receptor α: Intramolecular Interactions Studied by the Ab Initio Fragment Molecular Orbital Method

Watanabe, Chiduru, Fukuzawa, Kaori, Tanaka, Shigenori, Aida-Hyugaji, Sachiko

Журнал:

Journal of Physical Chemistry B

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 6.57 MB

english, 2014

15

Explicit solvation modulates intra- and inter-molecular interactions within DNA: Electronic aspects revealed by the ab initio fragment molecular orbital (FMO) method

Fukuzawa, Kaori, Kurisaki, Ikuo, Watanabe, Chiduru, Okiyama, Yoshio, Mochizuki, Yuji, Tanaka, Shigenori, Komeiji, Yuto

Журнал:

Computational and Theoretical Chemistry

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.99 MB

english, 2015

16

Novel type of virtual ligand screening on the basis of quantum-chemical calculations for protein–ligand complexes and extended clustering techniques

Kurauchi, Ryo, Watanabe, Chiduru, Fukuzawa, Kaori, Tanaka, Shigenori

Журнал:

Computational and Theoretical Chemistry

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.58 MB

english, 2015

17

Hydration of ligands of influenza virus neuraminidase studied by the fragment molecular orbital method

Tokuda, Kana, Watanabe, Chiduru, Okiyama, Yoshio, Mochizuki, Yuji, Fukuzawa, Kaori, Komeiji, Yuto

Журнал:

Journal of Molecular Graphics and Modelling

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.55 MB

english, 2016

18

Berry's Phase in the Multimode Peierls States

Kawarabayashi, Tohru, Ono, Yoshiyuki, Watanabe, Chiduru

Журнал:

Journal of the Physical Society of Japan

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 71 KB

english, 2008

19

Phonon Softening in Two-Dimensional Electron–Lattice System with Anisotropy

Watanabe, Chiduru, Chiba, Shutaro, Ono, Yoshiyuki

Журнал:

Journal of the Physical Society of Japan

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 394 KB

english, 2007

20

Prediction of the site of CYP3A4 metabolism of tolterodine by molecular dynamics simulation from multiple initial structures of the CYP3A4-tolterodine complex

Sato, Atsuko, Yuki, Hitomi, Watanabe, Chiduru, Saito, Jun-ichi, Konagaya, Akihiko, Honma, Teruki

Журнал:

Chem-Bio Informatics Journal

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 688 KB

english, 2017

21

A Preliminary Study of Correction for Inter Fragment Interaction Energy (IFIE) between Fragments Sharing Bond Detached Atom (BDA)

Nakano, Tatsuya, Mochidzuki, Yuji, Fukuzawa, Kaori, Okiyama, Yoshio, Watanabe, Chiduru

Журнал:

Journal of Computer Aided Chemistry

Рік:

2017

Файл:

PDF, 692 KB

2017

22

Characterization of crystal water molecules in a high-affinity inhibitor and hematopoietic prostaglandin D synthase complex by interaction energy studies

Takaya, Daisuke, Inaka, Koji, Omura, Akifumi, Takenuki, Kenji, Kawanishi, Masashi, Yabuki, Yukako, Nakagawa, Yukari, Tsuganezawa, Keiko, Ogawa, Naoko, Watanabe, Chiduru, Honma, Teruki, Aritake, Kosuke

Журнал:

Bioorganic & Medicinal Chemistry

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.47 MB

english, 2018

23

Towards good correlation between fragment molecular orbital interaction energies and experimental IC50 for ligand binding: A case study of p38 MAP kinase

Sheng, Yinglei, Watanabe, Hirofumi, Maruyama, Keiya, Watanabe, Chiduru, Okiyama, Yoshio, Honma, Teruki, Fukuzawa, Kaori, Tanaka, Shigenori

Журнал:

Computational and Structural Biotechnology Journal

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 870 KB

english, 2018

24

Fragment Molecular Orbital Calculations with Implicit Solvent Based on the Poisson–Boltzmann Equation: II. Protein and Its Ligand-Binding System Studies

Okiyama, Yoshio, Watanabe, Chiduru, Fukuzawa, Kaori, Mochizuki, Yuji, Nakano, Tatsuya, Tanaka, Shigenori

Журнал:

Journal of Physical Chemistry B

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 35.50 MB

english, 2018

25

The Translation Inhibitor Rocaglamide Targets a Bimolecular Cavity between eIF4A and Polypurine RNA

Iwasaki, Shintaro, Iwasaki, Wakana, Takahashi, Mari, Sakamoto, Ayako, Watanabe, Chiduru, Shichino, Yuichi, Floor, Stephen N., Fujiwara, Koichi, Mito, Mari, Dodo, Kosuke, Sodeoka, Mikiko, Imataka, Hiro

Журнал:

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 5.07 MB

english, 2018

26

A Radical Correction for Inter Fragment Interaction Energy (IFIE) between Fragments Sharing Bond Detached Atom (BDA); Bond detached atom (BDA)を共有しているフラグメント間の相互作用エネルギーの補正に関する試みII：ラジカル開裂補正;

Nakano, Tatsuya, Mochidzuki, Yuji, Fukuzawa, Kaori, Okiyama, Yoshio, Watanabe, Chiduru

Журнал:

Journal of Computer Aided Chemistry

Рік:

2019

Файл:

PDF, 889 KB

2019

27

A Radical Correction for Inter Fragment Interaction Energy (IFIE) between Fragments Sharing Bond Detached Atom (BDA); Bond detached atom (BDA)を共有しているフラグメント間の相互作用エネルギーの補正に関する試みII：ラジカル開裂補正;

Nakano, Tatsuya, Mochidzuki, Yuji, Fukuzawa, Kaori, Okiyama, Yoshio, Watanabe, Chiduru

Журнал:

Journal of Computer Aided Chemistry

Рік:

2019

Файл:

PDF, 889 KB

2019

28

Development of an automated fragment molecular orbital (FMO) calculation protocol toward construction of quantum mechanical calculation database for large biomolecules

Watanabe, Chiduru, Watanabe, Hirofumi, Okiyama, Yoshio, Takaya, Daisuke, Fukuzawa, Kaori, Tanaka, Shigenori, Honma, Teruki

Журнал:

Chem-Bio Informatics Journal

Рік:

2019

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.53 MB

english, 2019

29

[AIP LOW TEMPERATURE PHYSICS: 24th International Conference on Low Temperature Physics - LT24 - Orlando, Florida (USA) (10-17 August 2005)] AIP Conference Proceedings - Phonon Softening and Multimode Peierls Transition in a 2D Anisotropic Square-Lattice Electron-Lattice System with a Half-Filled Electronic Band

Watanabe, Chiduru, Chiba, Shutaro, Ono, Yoshiyuki

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 573 KB

english, 2006

30

High-precision Atomic Charge Prediction for Protein Systems Using Fragment Molecular Orbital Calculation and Machine Learning

Kato, Koichiro, Masuda, Tomohide, Watanabe, Chiduru, Miyagawa, Naoki, Mizouchi, Hideo, Nagase, Shumpei, Kamisaka, Kikuko, Oshima, Kanji, Ono, Satoshi, Ueda, Hiroshi, Tokuhisa, Atsushi, Kanada, Ryo, Oh

Журнал:

Journal of Chemical Information and Modeling

Рік:

2020

Файл:

PDF, 1.34 MB

2020

31

Identification of correlated inter-residue interactions in protein complex based on the fragment molecular orbital method

Tanaka, Shigenori, Watanabe, Chiduru, Honma, Teruki, Fukuzawa, Kaori, Ohishi, Kazue, Maruyama, Tadashi

Журнал:

Journal of Molecular Graphics and Modelling

Рік:

2020

Файл:

PDF, 863 KB

2020

32

Acceleration of environmental electrostatic potential using Cholesky decomposition with adaptive metric (CDAM) for fragment molecular orbital (FMO) method

Okiyama, Yoshio, Nakano, Tatsuya, Watanabe, Chiduru, Fukuzawa, Kaori, Komeiji, Yuto, Segawa, Katsunori, Mochizuki, Yuji

Журнал:

Bulletin of the Chemical Society of Japan

Рік:

2020

Файл:

PDF, 739 KB

2020